3-D Secure er en sikkerhetsstandard som Mastercard og VISA har utviklet i samarbeid for å øke sikkerheten ved kortbetalinger på nett. Instapay støtter Mastercard sin 3-D Secure autentisering som heter MasterCard SecureCode som består av en ytterligere sikkerhetssjekk etter at kunden har lagt inn sine kortopplysninger. Kunden får da opp et nytt vindu hvor identiteten må bekreftes via 3-D Secure om regel da via Bank ID eller Bank ID på mobil.